Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pola1P33609 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pola1P33609 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola1P33609 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola1P33609 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pola1P33609 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pola1P33609 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pola1P33609 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pola1P33609 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pola1P33609 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pola1P33609 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms