Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nedd1P33215 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms