Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Notch4P31695 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms