Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms