Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tacr1P30548 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms