Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msr1P30204 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Msr1P30204 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms