Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprmP28828 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprmP28828 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprmP28828 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprmP28828 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprmP28828 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
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