Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Hoxd10P28359 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd10P28359 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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