Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd9P28357 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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