Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apex1P28352 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apex1P28352 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms