Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms