Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-DMaP28078 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms