Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afxP27661 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2afxP27661 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms