Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms