Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna1P26231 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms