Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd1P25322 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms