Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms