Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk11bP24788 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms