Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf239P24399 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf239P24399 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms