Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd247P24161 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd247P24161 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd247P24161 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd247P24161 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd247P24161 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd247P24161 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd247P24161 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms