Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gria2P23819 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms