Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms