Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcer1aP20489 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms