Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TP20293 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TP20293 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TP20293 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms