Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P20040 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P20040 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P20040 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P20040 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P20040 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P20040 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P20040 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P20040 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P20040 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P20040 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P20040 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P20040 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P20040 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
P20040 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P20040 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P20040 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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