Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox5bP19536 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms