Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms