Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18524 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18524 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18524 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18524 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18524 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18524 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18524 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18524 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18524 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18524 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18524 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18524 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18524 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P18524 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18524 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18524 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18524 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18524 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18524 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18524 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18524 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18524 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18524 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18524 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18524 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18524 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18524 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18524 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18524 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18524 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18524 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18524 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18524 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18524 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18524 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18524 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms