Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcnaP17918 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PcnaP17918 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PcnaP17918 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PcnaP17918 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PcnaP17918 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PcnaP17918 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PcnaP17918 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcnaP17918 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcnaP17918 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms