Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms