Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou4f1P17208 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms