Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkceP16054 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PrkceP16054 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkceP16054 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms