Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prph2P15499 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms