Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd44P15379 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd44P15379 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms