Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms