Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms