Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcp1P11983 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms