Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtcP11725 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtcP11725 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtcP11725 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtcP11725 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtcP11725 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtcP11725 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtcP11725 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtcP11725 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtcP11725 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtcP11725 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtcP11725 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtcP11725 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtcP11725 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtcP11725 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtcP11725 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtcP11725 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtcP11725 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtcP11725 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtcP11725 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtcP11725 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtcP11725 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtcP11725 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtcP11725 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtcP11725 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtcP11725 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtcP11725 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtcP11725 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtcP11725 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtcP11725 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtcP11725 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtcP11725 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtcP11725 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtcP11725 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtcP11725 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtcP11725 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtcP11725 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtcP11725 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtcP11725 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtcP11725 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtcP11725 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtcP11725 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtcP11725 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtcP11725 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtcP11725 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtcP11725 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtcP11725 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OtcP11725 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtcP11725 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtcP11725 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtcP11725 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtcP11725 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtcP11725 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtcP11725 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtcP11725 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtcP11725 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtcP11725 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtcP11725 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms