Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DmdP11531 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DmdP11531 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DmdP11531 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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DmdP11531 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DmdP11531 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DmdP11531 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DmdP11531 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DmdP11531 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DmdP11531 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DmdP11531 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DmdP11531 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DmdP11531 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DmdP11531 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DmdP11531 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DmdP11531 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DmdP11531 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DmdP11531 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DmdP11531 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DmdP11531 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DmdP11531 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DmdP11531 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DmdP11531 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DmdP11531 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DmdP11531 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DmdP11531 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DmdP11531 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms