Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fv4P11370 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fv4P11370 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fv4P11370 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms