Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms