Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nid1P10493 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nid1P10493 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nid1P10493 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nid1P10493 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms