Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb4P10284 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms