Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amd1P0DMN7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms