Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms