Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc9P09633 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms