Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtaP09225 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtaP09225 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LtaP09225 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LtaP09225 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtaP09225 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LtaP09225 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LtaP09225 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtaP09225 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtaP09225 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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