Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb7P09024 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb7P09024 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms