Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a2P08122 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms