Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Egr1P08046 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Egr1P08046 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Egr1P08046 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Egr1P08046 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms